Basic analysis
Blast
Conservation Analysis
Homework
- 按照 0) Files Needed 所示下载准备好的作业文件（NPF.fa），里面是几种代表性作物的NPF家族部分基因的CDS序列集合。请根据操作流程的指示，使用距离法、最大简约法和最大似然法进行系统发育树（1000 Bootstrap）的构建，并以PDF或图片的形式保留最终结果。
- 自行查阅相关资料，回答下列问题：
（1）试结合最终结果，解释original tree和Bootstrap consensus tree之间的区别；
（2）从构建原理的角度，简单解释不同构建方法所需时间有较大差异的原因。
（3）以同样的方法分析同样的数据，所产生的树有可能存在不同吗？为什么？
