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生信分析-4 生信分析-4
RNA-seq pipeline 数据分析流程 原始数据 数据质控 比对质控数据 比对上的数据的下游分析 – 基因表达差异分析、基因可变剪切、SNP/INDEL分析 软件安装(针对MAC系统) 用Anaconda快速搭建生物信息学分析平
2020-05-11 bioinfo
生信分析基础-1 生信分析基础-1
2020-05-10 生信基础
生信分析_3 生信分析_3
Basic analysis BlastConservation Analysis详情参见conservation analysis Homework 按照 0) Files Needed 所示下载准备好的作业文件（NPF.fa），里面
2020-05-06 bioinfo
python_进阶_24 python_进阶_24
jupter notebook – python 使用Jupiter notebook 操作 以下python命令, 详见lu_lab_tutorial 输出为 结果 Python的列表推导式，字典推导式，集合推导式使用方法详见Pytho
2020-05-05 python
R_基础1 R_基础1
详见R basics Homework 用R语言实现以下的任务描述，作业提交一个word文档，包含实现下列步骤的R代码和每一步输出结果的截图。 安装vcd包（一个用于可视化类别数据的包） 列出此包中可用的函数和数据集。 载入这个包并阅
2020-05-05 R
生信分析_2 生信分析_2
Linux Bash 在介绍bash之前，需要先介绍它的起源——shell。shell俗称壳，它是指UNIX系统下的一个命令解析器；主要用于用户和系统的交互; bash，全称为Bourne-Again Shell。它是一个为GNU项目编写的
2020-05-03 bioinfo
生信分析_1 生信分析_1
practice guide - linux 本章内容主要是学会用Linux的一些简单编程方法去查看GTF/GFF基因组注释文件的基本信息，并学会对文件中数据进行提取，利用提取到的数据计算特定feature（例如计算基因积累长度等）。
2020-05-03 bioinfo
git git
Mac上使用Git+Github 详细教程参见Mac上使用Git+Github
2020-04-30 git
vi编辑器 vi编辑器
vi – 终端中的编辑器 vi是visual interface的简称,是Linux中最经典的文本编辑器 Vim = vi improved vim是vi发展出来的一个文本编辑器,支持代码补全、编译及错误跳转等方便编程的功能,被称为编辑
2020-04-30 linux
python_进阶_23 python_进阶_23
eval 函数 eval()函数十分强大 – 将字符串 当成 有效的表达式 来求值 并 返回计算结果 # 基本的数学计算 In [1]: eval("1 + 1") Out[1]: 2 # 字符串变量 In [2]: eval("'*'
2020-04-30 python
python_进阶_22 python_进阶_22
文件 打开文件# 1. 打开 - 文件名需要注意大小写 file = open("README") # README是一个“.txt”文件 # 2. 读取 text = file.read() print(text) # 3. 关闭
2020-04-30 python
python_进阶_21 python_进阶_21
制作发布压缩包 创建set.up.py文件 set.up.py的文件 from distutils.core import setup setup(name=”zzn_message”, # 包名version=”1.0”, # 版本
2020-04-29 python
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